Programa de Pós-Graduação em Nanobiossitemas

EDITAL PARA INGRESSO DE NOVOS DOCENTES

Período de inscrição: As inscrições para o credenciamento de novos docentes no PPGIMNANOBIOS estarão abertas no período de 18/12/2023 à 31/01/2024.

Edital - Clique aqui

Resultado final do credenciamento de novos docentes -Clique aqui

oportunidade: Edital para concessão de 01 Bolsa CAPES de Pós Doutorado

Valor da bolsa R$ R$5.200,00 (cinco mil e duzentos reais) ao mês.

Duração de 1 ano, prorrogável por igual período.

Inscrições de 18 de outubro a 6 de dezembro de 2023.

Planos de Trabalho primeiro ano

Planos de Trabalho segundo ano

No presente projeto, o pesquisador selecionado trabalhará com modelos de redes de regulação gênica fazendo uso das estratégias teóricas desenvolvidas por Waddington [1] e Kauffman [2]. O objetivo principal é o estudo dos mecanismos moleculares envolvidos na transição entre os subtipos Luminal, HER2+ e Triplo Negativo, no câncer de mama.

O Instituto Nacional de Câncer (INCA) estima que para cada ano do triênio 2020/2022, sejam diagnosticados no Brasil 66.280 novos casos de câncer de mama. De acordo com o Dr Ben Anderson, Medical Officer, Cancer Control, Organização Mundial da Saúde:

"O câncer de mama é o câncer mais comum a nível mundial e a razão mais provável para uma mulher morrer de cancer".

O presente projeto fará uso de dados experimentais produzidos no Instituto Nacional do Câncer; provenientes tanto de pacientes quanto de amostras de cultura de células. Trata-se de um projeto que busca aplicar conceitos avançados da Biologia Computacional para o bem-estar da população e para combater uma doença com enormes consequências humanas e sociais.

O programa de Pós-Graduação em NanoBioSistemas é uma parceria entre a Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ, Faculdade de Farmácia e Campus Duque de Caxias), O Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC), A Fiocruz (Bio-Manguinhos e Instituto Oswaldo Cruz) e o Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia (Inmetro).

O Campus da UFRJ Duque de Caxias, que está localizado na cidade de Duque de Caxias [3] fica estrategicamente localizado a distâncias similares da cidade do Rio de Janeiro [4] e da cidade de Petrópolis [5]. Dessa forma, o pesquisador terá a opção de morar em qualquer dessas duas cidades, ou mesmo na cidade de Duque de Caxias [5].

O Prof. Dr. Francisco Lopes [6,7] será responsável pela supervisão do projeto.

Para mais informações, acesse o link para o edital e os planos de trabalho.

Caso deseje mais informações, não hesite em nos contactar: O endereço de e-mail address está sendo protegido de spambots. Você precisa ativar o JavaScript enabled para vê-lo.

Aguardamos sua inscrição para participar desse projeto extremamente animador e gratificante.

Prof. Francisco Lopes

[1] Bistability, Bifurcations, and Waddington's Epigenetic Landscape. J. Ferrell. Published in Current Biology 5 June 2012. Biology.

[2] Huang S, Ernberg I, Kauffman S. Cancer attractors: a systems view of tumors from a gene network dynamics and developmental perspective. Semin Cell Dev Biol. 2009 Sep;20(7):869-76.

[3] https://maps.app.goo.gl/JtUX3rv62GaCyUKu8

[4] https://maps.app.goo.gl/x5W8LrJsswQSmrkdA

[5] https://maps.app.goo.gl/E4fyscgmyeiyQoi37

[6] https://orcid.org/0000-0002-2715-2341

Profa. Dra. Helena Keiko Toma

Coordenadora do Programa

Professora Associada da Faculdade de Farmácia - UFRJ

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Prof. Dr. Karim Dahmouche

Vice-coordenador do Programa

Professor Adjunto do Campus Duque de Caxias - UFRJ

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Área Nanotecnologia

Programa

1. Estrutura cristalina de materiais: nucleação e crescimento de cristais e nanocristais;

2. Princípios básicos da interação luz-matéria;

3. Síntese, estrutura e propriedades de nanopartículas;

4. Propriedades de soluções e coloides. Auto-organização: micelas e membranas biológicas;

5. Exemplos de aplicações tecnológicas de nanomateriais

Bibliografia sugerida:

- CALLISTER, W.D., RETHWISCH, D.G, “Ciência e Engenharia dos Materiais, Uma introdução”, Nona Edição, LTC

- Atkins P., De Paula J, “Fisico-Quimica”, Vol.2, Nona ediçao LTC (2012)

- Halliday, Resnik, Krane. "Física 4". LTC

- D. Vollath. Nanomaterials: an Introduction to Synthesis, Properties and Applications, 2o edição, Wiley-VCH (2013).

- G. Cao; Y. Wang. Nanostructures and Nanomaterials - Synthesis, Properties, and Applications. World Scientific (2011).

Área Biologia

Programa

1. Células e genomas

2. Bioenergética e química celular

3. Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas

4. Mecanismos genéticos básicos

5. DNA, cromossomos e genomas

6. Replicação, reparo e recombinação do DNA

7. Como as células leem o genoma: do DNA à proteína

8. Controle da expressão gênica

9. Patógeno, infecção e imunidade inata

10. Sistema imune adaptativo

Bibliografia sugerida:

- Biologia Molecular da Célula - 6ª Ed. Alberts, Bruce

- Princípios de Bioquímica de Lehninger - 6ª Ed. Nelson,DavidL.Cox,Michael -2014

- Imunologia celular e molecular. Abbas, Lichtman & Pillai, 8ª edição, Elsevier, 2015

Área de computação/matemática

Programa

1. Algoritmos: conceito básico; representação em pseudocódigo; estruturas de decisão; estruturas de iteração; recursividade; strings; busca e ordenação de vetores (listas)

2. Noções básicas de linguagem de programação (C ou Python)

3. Estruturas de dados elementares: listas, filas, pilhas, matrizes

4. Matrizes: propriedades básicas; operações; sistemas de equações lineares; determinante e matriz inversa

5. Análise Combinatória: permutações, combinações, demonstração por indução matemática

6. Cálculo de função real de uma variável real

6.1. Derivada e sua interpretação geométrica

6.2. Aplicações da derivada: Extremos locais das funções

6.3. Antiderivadas

Bibliografia sugerida:

- H. Cormen, C. E. Leiserson, R. L. Rivest, C. Stein, "Introduction to Algorithms", 3.ed., The MIT Press, 2009

- R. Korfhage, "Discrete Computational Structures", série Computer Science and Applied Mathematics, 2.ed., New York, Academic Press 1984

- L Boldrini, S. I. Rodrigues Costa, V. L. Figueiredo, H. G. Wetzler. Álgebra Linear, Editora Harbra Ltda., 3ª edição, 1986.

- N.N.C. Menezes, "Introdução à programação com Python: algoritmos e lógica de programação para iniciantes", São Paulo, Novatec, 2010.

- SCHILDT, H, C – Completo e Total, Makron Books, 3a Edição, Pearson,1996.

- LEITHOLD, L. O Cálculo com Geometria Analítica. Vol. 1, São Paulo: Harbra, 3ª edição,1994.

- SWOKOWSKI, E. W. Cálculo com geometria analítica. Vol. 1, 2ª edição, McGRAW-HILL do Brasil, 1983.

Pesquisadora: Ana Carolina Rennó Sodero

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/2594571837199451

Linha de Pesquisa:

Atua na área de planejamento de fármacos, com ênfase em modelagem molecular de compostos bioativos, incluindo técnicas de modelagem de proteínas, docking molecular, dinâmica molecular e QSAR.

Pesquisadora: Andrea Claudia Freitas Ferreira

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/3093110964327608

Instituição: Universidade Federal do Rio de Janeiro

Linha de Pesquisa:

Efeito dos Desreguladores Endócrinos do Plástico Bisfenol (A e S) sobre a Proliferação e Invasão de Tireócitos

Impacto do Jejum Intermitente sobre a Geração de Espécies Reativas de Oxigênio e o Fenótipo do Tecido Adiposo Branco e Tireoide

Efeito de Adoçantes sobre a Função Tireoidea e Parâmetros Endócrino-Metabólicos

Pesquisador: Bráulio Soares Archanjo

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5548512717869486

Instituição: Inmetro

Linha de Pesquisa:

Nanociência, nanotecnologia e nanometrologia, incluindo as seguintes técnicas e temas: microscopia eletrônica de transmissão, microscopia eletrônica de varredura, feixe de íons focalizados (FIB), microscopia de feixe de íons de hélio, difração de raios X, espectroscopia micro Raman, microscopia de varredura por sonda, espectroscopia de fotoelétrons, deposição por vapor químico (CVD), autoconstrução, nano e microfabricação, materiais bidimensionais e carbono do solo.

Pesquisador: Carsten Enderlein

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/8774017472709472

Linha de Pesquisa:

Sistemas com acoplamento spin-órbita forte, telureno, fenômenos de transporte em sistemas nanométricas, efeitos topológicos.

Pesquisador: Carolina Lessa Aquino

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/8949950514484383

Linha de Pesquisa:

Expressão e purificação de proteínas recombinantes em sistema procarioto, células de inseto e células de mamífero para o desenvolvimento de imunobiológicos (vacinas, reagentes diagnósticos, biofármacos)

Pesquisador: Daniel Ernesto Rodríguez Fernández

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/3792095402010677

Linha de Pesquisa:

Produção de beta-galactosidase por via fermentativa a partir de resíduos da industria de lacticínios.

Desenvolvimento de processos fermentativos em estado sólido para produzir enzimas interesse industrial.

Estudos de imobilização, micro e nanoencapsulação de enzimas.

Pesquisador: Erlon Henrique Martins Ferreira

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/1092649238010894

Instituição: Inmetro

Linha de Pesquisa:

Caracterização de nano e biomateriais por métodos de espectroscopia óptica, com ênfase em Raman, FT-IR e UV-VIS. Estudos das propriedades físico-químicas e estruturais de nanomateriais a base de carbono tais como grafeno, nanotubos e fulerenos, e aplicações em nanobiossistemas.

Pesquisador: Fábio Lima Custódio

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/9126339190151859

Linha de Pesquisa:

Modelagem Molecular Inteligência Artificial e Aprendizagem de Máquina Planejamento de Fármacos Baseado em Estrutura Predição de Estruturas de Proteínas Imunoinformática Desenvolvimento de Métodos, Algoritmos e Programas em Modelagem Molecular

Pesquisador: Fabrício Alves Barbosa da Silva

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/6679069461879682

Linha de Pesquisa:

1 - Modelagem computacional be bactérias multirresistentes
2 - Modelagem computacional do cancer
3 - Modelagem computacional da COVID-19

Grupo de pesquisa: "Modelagem Computacional de Bactérias Multirresistentes"

Pesquisador: Helvécio V. A. Rocha

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/2176296530102185

Linha de Pesquisa:

- Sistemas de liberação de fármacos.

- Métodos de caracterização do estado sólido de fármacos e medicamentos.

- Ensaios de liberação in vitro de fármacos.

- Tecnologia farmacêutica.

- Pré-formulação farmacêutica.

Pesquisador: Rodrigo Ornellas Meire

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/0984492682627713

Linha de Pesquisa:

Toxicologia Ambiental

Saúde Ambiental

Ciências Ambientais

Remediação de áreas contaminadas

Monitoramento de poluentes ambientais

Informações: Tenho interesse em estudos ligados ao transporte de poluentes ambientais e seus riscos potenciais a saúde humana, assim como no desenvolvimento de tecnologias voltadas para o monitoramento e redução de impactos ambientais no tema.

Pesquisador: Francisco JP Lopes

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Linha de Pesquisa:

- Caracterização e modelagem da via de NFkB no câncer de mama.

- Estudo da Drosophila melanogaster como organismo modelo para aanálise de atividade e toxicidade de fármacos e nanopartículas.

- Modelagem das redes de sinalização do NFkB no sistema imune.

Em colaboração com o grupo do Professor Alexander Hoffmann (University of California Los Angeles - UCLA).

Pesquisador: Haroldo Cid da Silva Junior

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/4010157454608940

Instituição: Bio-Manguinhos / Fiocruz

Linha de Pesquisa:

1-Desenvolvimento de vacinas e terapias baseadas na tecnologia de RNAm

2- Desenvolvimento de anticorpos biespecíficos

3- Expressão de proteínas recombinantes de interesse farmacêutico

Pesquisadora: Helena Keiko Toma

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/8121311753666435

Linha de Pesquisa:

Diagnóstico molecular de agentes patogênicos de interesse médico e veterinário

Diagnóstico de alterações genéticas humanas

Genotipagem e caracterização de agentes patogênicos

Pesquisadora: Joyce Rodrigues de Araujo

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/8715885877497181

Instituição: Inmetro

Linha de Pesquisa:

Síntese e aplicações de nanomateriais de carbono tais como óxido de grafeno partindo-se de diferentes matérias primas, tais como grafite e resíduos de biomassa (bambu, lignina, casca de arroz e serragem de madeira). Fabricação de sensores de pressão e sensores eletroquímicos de grafeno para aplicações nas áreas farmacêtutica e de alimentos. Preparação e caracterização de nanocompósitos poliméricos reforçados com nanomateriais de carbono e aplicação de nanomateriais de carbono na indústria da construção civil (asfalto e cimento). Análise química de superfícies por espectroscocpia de fotoelétrons excitados por raios-X e espectroscopia Auger.

Pesquisador: Kary Ann del Carmen Ocaña Gautherot

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/1435339422167961

Linha de Pesquisa:

Atualmente, sua área de atuação principal é em Bioinformática e Biologia Computacional atuando principalmente nos seguintes temas: genômica comparativa, evolutiva e funcional; análise filogenética e filogenômica; desenvolvimento de métodos matemáticos e ferramentas computacionais aplicados à genômica; workflows científicos e análise de dados científicos em larga escala em ambientes de processamento de alto desempenho (PAD).

Pesquisador: Karim Dahmouche

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/1429649904810032

Instituição: UFRJ-Campus de Duque de Caxias

Linha de Pesquisa:

Nanocomposítos híbridos orgânicos-inorgânicos para liberação controlada ou prolongada de fármacos

Nanocomposítos híbridos orgânicos-inorgânicos condutores iônicos para aplicações em dispositivos de energia limpa (baterias de lítio, células solares ou células a combustível)

Nanocomposítos híbridos orgânicos-inorgânicos para remoção de poluentes

Informações: Possui colaborações internacionais com o CEA (Grenoble-França), CEA (Paris-Saclay-França) e HzB (Berlim-Alemanha) com possibilidade de estadia de doutorado sandwich para alunos.

Pesquisadora: Kattya Gyselle de Holanda e Silva

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/1504062128168961

Linha de Pesquisa:

Desenvolvimento de nanosistemas lipídios para liberação de moléculas insolúveis;

Desenvolvimento de sistemas híbridos (polímero/Lipídeo) para aplicação tópica.

Pesquisador: Laurent Emmanuel Dardenne

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/8344194525615133

Instituição: LNCC

Linha de Pesquisa:

Modelagem Molecular

Planejamento de Fármacos Baseado em Estrutura

Predição de Estruturas de Proteínas

Desenho Racional de Anticorpos

Desenvolvimento de Métodos, Algoritmos e Programas em Modelagem Molecular

Pesquisador: Luiz Augusto Sousa de Oliveira

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/9983671664979598

Linha de Pesquisa:

Produção de materiais magnéticos nanoestruturados voltados para aplicações multidisciplinares (ex. biomedicina, eletrônica, ecologia e hipertermia magnética); - Modelagem e simulação magnética de materiais magnéticos nanoestruturados em GPU via CUDA; - Desenvolvimento de instrumentação científica, sistemas de medidas, automação e controle (eletrônica, mecânica, informática...) voltados para o nanomagnetismo.

Pesquisadora: Marisa Fabiana Nicolas

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/0717161560405537

Linha de Pesquisa:

genômica, bioinformática, priorização de alvos moleculares.

Informações: Tem experiência na área de Genética, Biologia Molecular, Genômica e Bioinformática. Atua principalmente em Bioinformática aplicada a análise de genomas e transcriptomas e redes metabólicas e regulatórias em bactérias, em particular as patogênicas clínicas.

Pesquisador: Marcus Vinicius de Oliveira Moutinho

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/3263616865414326

Linha de Pesquisa:

Cálculos de primeiros princípios dentro da Teoria do Funcional da Densidade (DFT) das propriedades estruturais, eletrônicas, vibracionais e óticas de sistemas nanoestruturados, como grafeno, nanotubos e heteroestruturas bidimensionais

Pesquisador: Natasha Midori Suguihiro

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/8723854673910513

Linha de Pesquisa:

Síntese e caracterização de nanomateriais e correlação com suas propriedades.

Nanotecnologia aplicada a processos ambientais: monitoramento e remediação de poluentes emergentes, persistentes e metais pesados.

Pesquisador: Pedro Pascutti

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/6142558410927273

Instituição: UFRJ - IBCCF

Linha de Pesquisa:

1 - Modelagem molecular em sistemas biológicos;

2 - Planejamento computacional de fármacos;

3 - Enovelamento de proteínas;

4 - Estrutura eletrônica de biomoléculas;

5 - Simulações em biomembranas

Informações: Localização: Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular - Bloco D, sala 30, CCS - UFRJ; fone 39386507

Pesquisador: Reginaldo Almeida da Trindade

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/2125912718440516

Instituição: Faculdade de Farmácia, UFRJ

Linha de Pesquisa:

Microencapsulação de proteínas e peptídeos em sistemas poliméricos para aplicação biológica;

Pesquisador: Roberto Jakomin

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/1915624909357425

Instituição: Campus Duque de Caxias, UFRJ

Linha de Pesquisa:

Síntese e estudo de nanomateriais, como óxidos mesoporosos, para diferentes aplicações em particular células fotovoltaicas;

Fabricação e caracterização de células solares híbridas e orgânicas nanoestruturadas em substratos rígidos e flexíveis

Crescimento de pontos quânticos e nanofios de semicondutores III-V para aplicações fotovoltaicas e fotodetectores.

Informações: Laboratórios: LADOR (Dimat-Inmetro), NUMPEX-NANO (UFRJ-Campus Duque de Caxias), LABSEM (Puc-Rio)

Pesquisador: Theo Luiz Ferraz de Souza

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/1459804709960196

Instituição: Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio de Janeiro

Linha de Pesquisa:

(Nano)biotecnologia e Ciências ômicas aplicada no desenvolvimento de (bio)fármacos, vacinas de peptídeos, nutracêuticos, teranósticos e métodos de diagnóstico;

Termodinâmica, Bioespectroscopia, e Biologia computacional na exploração estrutural, funcional, imunológica e toxicológica de Biomoléculas;

Biotecnologia e Controle de qualidade de produtos biofarmacêuticos

Pesquisador: Thiago de Lourenço e Vasconcelos

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/0630866200168453

Instituição: Inmetro

Linha de Pesquisa:

Fabricação e funcionalização de nanodispositivos plasmônicos por litografia por feixe de íons e por feixe de elétrons (substrato SERS, sondas para TERS, substratos para diagnóstico médico). Caracterização de nanomateriais por MT e MEV e caracterização de características plasmônicas de nanoestruturas metálicas por meio da técnica de EELS em MET. Caracterização de nanomateriais e nanobiossistemas por meio da inovadora técnica de Nano-Raman (tip enhanced Raman spectroscopy – TERS).

Pesquisadora: Viviane Lione

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CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/7700565158061560

Instituição: Farmácia - UFRJ

Linha de Pesquisa:

Avaliação de novos sistemas de liberação nanométricos de fármacos em cultura de células;

Avaliação Farmacológica, Biofarmacêutica e Perfil de Toxicidade de moléculas com potencial terapêutico;

Desenvolvimento de Biofármacos para remoção de fragmentos metálicos no corpo humano;

Desenvolvimento de biomodelos para a compreensão da neurobiologia relacionada ao autismo.

Atualizado em 21/11/2023

Processo Seletivo

A Coordenação do Programa de Pós-Graduação em Nanobiossistemas torna público o Edital nº 1413, de 13 de novembro de 2023 para seleção de corpo discente dos cursos de MESTRADO, DOUTORADO e DOUTORADO DIRETO do Programa.

Para este edital serão oferecidas 10 (dez) vagas para o curso de Mestrado, 05 (cinco) vagas para o curso de Doutorado e Doutorado Direto a serem preenchidas de acordo com a ordem de classificação dos candidatos no processo seletivo.

As inscrições estarão abertas de 16/11/2023 a 31/01/2024 através do formulário de inscrição abaixo.

Acesso ao formulário de inscrição: https://forms.gle/DGzMXuTyaBsHU67v9

Inscrições homologadas: Clique aqui (Resultado)

Formulário para recurso: https://forms.gle/oN2E5jHL48XFFFYr6

Resultado final após recurso (Cique aqui)

Resultado do recurso (Clique aqui)

DIVULGAÇÃO DAS DATAS E HORÁRIOS DAS ARGUIÇÕES ORAIS - clique aqui

RESULTADO PRELIMINAR - clique aqui

Recurso contra RESULTADO PRELIMINAR:

https://forms.gle/rJPKBFqJmWV6FEJb7

Edital

Modelo_TERMO_DE_AUTODECLARACAO_ETNICO-RACIAL